MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 chromosome

Total Repeats: 81636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017297	AATA	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	384460460
2	NC_017297	AAGT	2	8	65	72	50 %	25 %	25 %	0 %	384460460
3	NC_017297	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460460
4	NC_017297	TTAC	2	8	205	212	25 %	50 %	0 %	25 %	384460460
5	NC_017297	A	7	7	216	222	100 %	0 %	0 %	0 %	384460460
6	NC_017297	ACT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460460
7	NC_017297	GAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460460
8	NC_017297	A	6	6	254	259	100 %	0 %	0 %	0 %	384460460
9	NC_017297	A	7	7	263	269	100 %	0 %	0 %	0 %	384460460
10	NC_017297	ATA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460460
11	NC_017297	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460460
12	NC_017297	CTA	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460460
13	NC_017297	GCA	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384460460
14	NC_017297	TAGCAG	2	12	392	403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384460460
15	NC_017297	TTTA	2	8	429	436	25 %	75 %	0 %	0 %	384460460
16	NC_017297	TA	3	6	435	440	50 %	50 %	0 %	0 %	384460460
17	NC_017297	TGG	2	6	441	446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384460460
18	NC_017297	ATGC	2	8	472	479	25 %	25 %	25 %	25 %	384460460
19	NC_017297	TA	3	6	490	495	50 %	50 %	0 %	0 %	384460460
20	NC_017297	AGT	2	6	519	524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460460
21	NC_017297	TCT	2	6	532	537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384460460
22	NC_017297	AATT	3	12	554	565	50 %	50 %	0 %	0 %	384460460
23	NC_017297	GAT	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460460
24	NC_017297	AAAT	2	8	597	604	75 %	25 %	0 %	0 %	384460460
25	NC_017297	TGA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460460
26	NC_017297	AGAA	2	8	657	664	75 %	0 %	25 %	0 %	384460460
27	NC_017297	AACA	2	8	709	716	75 %	0 %	0 %	25 %	384460460
28	NC_017297	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460460
29	NC_017297	AGA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460460
30	NC_017297	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	384460460
31	NC_017297	TA	4	8	896	903	50 %	50 %	0 %	0 %	384460460
32	NC_017297	TAA	2	6	947	952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460460
33	NC_017297	TAG	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460460
34	NC_017297	TCA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460460
35	NC_017297	TAA	2	6	978	983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460460
36	NC_017297	AAAC	2	8	1036	1043	75 %	0 %	0 %	25 %	384460460
37	NC_017297	ATT	2	6	1063	1068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460460
38	NC_017297	AAG	2	6	1070	1075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460460
39	NC_017297	TAT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460460
40	NC_017297	AGA	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460460
41	NC_017297	AGA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460460
42	NC_017297	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460460
43	NC_017297	TAC	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460460
44	NC_017297	TAA	2	6	1266	1271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460460
45	NC_017297	A	7	7	1275	1281	100 %	0 %	0 %	0 %	384460460
46	NC_017297	TAAA	2	8	1313	1320	75 %	25 %	0 %	0 %	384460460
47	NC_017297	AAAAAT	2	12	1331	1342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460460
48	NC_017297	A	7	7	1617	1623	100 %	0 %	0 %	0 %	384460461
49	NC_017297	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460461
50	NC_017297	TTA	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460461
51	NC_017297	TAA	2	6	1711	1716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
52	NC_017297	AGA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
53	NC_017297	ATA	2	6	1829	1834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
54	NC_017297	AAAT	2	8	1860	1867	75 %	25 %	0 %	0 %	384460461
55	NC_017297	AGA	2	6	1873	1878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
56	NC_017297	ATA	2	6	1892	1897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
57	NC_017297	AT	4	8	1922	1929	50 %	50 %	0 %	0 %	384460461
58	NC_017297	TAT	2	6	1957	1962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460461
59	NC_017297	A	6	6	2002	2007	100 %	0 %	0 %	0 %	384460461
60	NC_017297	TAG	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460461
61	NC_017297	AAG	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
62	NC_017297	GTT	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384460461
63	NC_017297	GATAAT	2	12	2150	2161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460461
64	NC_017297	AGA	3	9	2215	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
65	NC_017297	TTTA	2	8	2263	2270	25 %	75 %	0 %	0 %	384460461
66	NC_017297	AAT	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
67	NC_017297	ATT	2	6	2299	2304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460461
68	NC_017297	TTA	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460461
69	NC_017297	GAA	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
70	NC_017297	ATA	2	6	2360	2365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
71	NC_017297	CT	3	6	2404	2409	0 %	50 %	0 %	50 %	384460461
72	NC_017297	AAG	2	6	2418	2423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
73	NC_017297	GAT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460461
74	NC_017297	TAA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
75	NC_017297	GAA	2	6	2504	2509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460461
76	NC_017297	AGT	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460461
77	NC_017297	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460461
78	NC_017297	A	6	6	2641	2646	100 %	0 %	0 %	0 %	384460461
79	NC_017297	AAT	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460461
80	NC_017297	AATT	2	8	2737	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	384460462
81	NC_017297	ATA	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460462
82	NC_017297	TTCT	2	8	2764	2771	0 %	75 %	0 %	25 %	384460462
83	NC_017297	CAA	2	6	2787	2792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384460462
84	NC_017297	T	6	6	2813	2818	0 %	100 %	0 %	0 %	384460462
85	NC_017297	AAGTTA	2	12	2832	2843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384460462
86	NC_017297	A	6	6	2856	2861	100 %	0 %	0 %	0 %	384460462
87	NC_017297	GAC	2	6	2885	2890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384460462
88	NC_017297	TAA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460462
89	NC_017297	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460462
90	NC_017297	TA	3	6	3011	3016	50 %	50 %	0 %	0 %	384460463
91	NC_017297	A	6	6	3016	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	384460463
92	NC_017297	TAA	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
93	NC_017297	ATG	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460463
94	NC_017297	CAAATA	2	12	3075	3086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384460463
95	NC_017297	TAA	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
96	NC_017297	TA	3	6	3133	3138	50 %	50 %	0 %	0 %	384460463
97	NC_017297	ATAAAG	2	12	3171	3182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384460463
98	NC_017297	ATA	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
99	NC_017297	AT	3	6	3264	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	384460463
100	NC_017297	A	6	6	3281	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	384460463
101	NC_017297	TAAA	2	8	3297	3304	75 %	25 %	0 %	0 %	384460463
102	NC_017297	ATAAAA	2	12	3305	3316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384460463
103	NC_017297	A	8	8	3313	3320	100 %	0 %	0 %	0 %	384460463
104	NC_017297	TGT	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384460463
105	NC_017297	AGA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460463
106	NC_017297	AAT	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
107	NC_017297	TAT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460463
108	NC_017297	ATA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
109	NC_017297	GAAA	2	8	3485	3492	75 %	0 %	25 %	0 %	384460463
110	NC_017297	A	6	6	3502	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	384460463
111	NC_017297	ATG	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460463
112	NC_017297	AG	3	6	3583	3588	50 %	0 %	50 %	0 %	384460463
113	NC_017297	TAAAT	2	10	3604	3613	60 %	40 %	0 %	0 %	384460463
114	NC_017297	ATT	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460463
115	NC_017297	AAG	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460463
116	NC_017297	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460463
117	NC_017297	ATT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384460463
118	NC_017297	A	7	7	3742	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	384460463
119	NC_017297	GA	3	6	3755	3760	50 %	0 %	50 %	0 %	384460463
120	NC_017297	GAT	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460463
121	NC_017297	AAGT	2	8	3798	3805	50 %	25 %	25 %	0 %	384460463
122	NC_017297	ACA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384460463
123	NC_017297	CAT	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384460463
124	NC_017297	ATA	2	6	3890	3895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
125	NC_017297	A	6	6	3895	3900	100 %	0 %	0 %	0 %	384460463
126	NC_017297	ATA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
127	NC_017297	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460463
128	NC_017297	TAA	2	6	4005	4010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
129	NC_017297	AGA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460463
130	NC_017297	AAG	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384460463
131	NC_017297	TAA	2	6	4075	4080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384460463
132	NC_017297	TTC	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384460464
133	NC_017297	GTA	3	9	4147	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384460464
134	NC_017297	GGAT	2	8	4242	4249	25 %	25 %	50 %	0 %	384460464
135	NC_017297	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384460464
136	NC_017297	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	384460464
137	NC_017297	ACTA	2	8	4347	4354	50 %	25 %	0 %	25 %	384460464
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